乳腺癌-冠心病標(biāo)志物的生物信息篩選技術(shù)

　　運(yùn)用生物信息學(xué)方法篩選乳腺癌-冠心病標(biāo)志物，為乳腺癌誘發(fā)的冠心病治療提供潛在的作用靶點(diǎn)。從基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)（ gene expression omnibus，（EO）中下載乳腺癌和冠心病相關(guān)表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù)，使用GEOR篩選差異表達(dá)基因，依據(jù)Ⅴen圖交集獲取差異共表達(dá)基因，通過(guò) DAVID網(wǎng)站進(jìn)行基因功能注釋（ gene ontology，GO）及京都基因與基因組百科全書(shū)（KyooEncyclopedia of Genes and Genomes，KEGG）生物功能富集分析， STRING網(wǎng)站和 Cytoscape3.7.2軟件進(jìn)行蛋白互作分析。GEPIA和 Kaplan- Meier plotter進(jìn)行對(duì)乳腺癌患者h(yuǎn)ub基因mRNA表達(dá)水平和預(yù)后分析。結(jié)果表明：2個(gè)數(shù)據(jù)集篩選得到差異表達(dá)基因286個(gè)，基于在乳腺癌中mRNA顯著性表達(dá)水平篩選出45個(gè)基因。GO功能富集分析發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)基因主要在泛素蛋白轉(zhuǎn)移酶活性、糖蛋白結(jié)合、泛素蛋白連接酶結(jié)合等生物學(xué)過(guò)程發(fā)揮作用。KFGG分析顯示差異基因主要參與縫隙連接、腎素分泌、5-羥色胺能突觸、谷氨酸能突觸、血管平滑肌收縮、血小板活化、癌細(xì)胞蛋白多糖等多條信號(hào)通路?；颚蠷NA表達(dá)水平和預(yù)后分析顯示NIN、 POSTN、MAPT、MYO6、 MAPIB、FBO31、KⅣ、PK3R1等8個(gè)與冠心病相關(guān)的hub基因參與乳腺癌的發(fā)生、發(fā)展過(guò)程。NIN、 POSTN、MAPT、MYO6、MAPB、FBXO31KI、PIK3R可作為檢測(cè)乳腺癌誘導(dǎo)冠心病的潛在標(biāo)志物。