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上海生物芯片

文章:57 被閱讀:12.3w 粉絲數(shù):2 關(guān)注數(shù):0 點贊數(shù):1

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數(shù)據(jù)降維聚類工具介紹——SpatialPCA

現(xiàn)有常用的空間轉(zhuǎn)錄組降維聚類方法,如主成分分析(principal component analys....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 02-07 11:19 ?589次閱讀
數(shù)據(jù)降維聚類工具介紹——SpatialPCA

人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的原理和多種神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)方法

在上一篇文章中,我們介紹了傳統(tǒng)機器學習的基礎(chǔ)知識和多種算法。在本文中,我們會介紹人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的原理和....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 01-09 10:24 ?1159次閱讀
人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的原理和多種神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)方法

生物芯片開放創(chuàng)新中心榮獲創(chuàng)新型孵化器認定

近日,上海市浦東新區(qū)科技和經(jīng)濟委員會發(fā)布的2024年第二批浦東新區(qū)創(chuàng)新型孵化器登記名單的通知,生物芯....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 01-07 11:37 ?575次閱讀

ComplexHeatmap包:個性化熱圖繪制利器

? 熱圖在很多文章中都有出現(xiàn),如何畫出讓人眼前一亮的熱圖?ComplexHeatmap包具有非常高的....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 12-31 11:17 ?373次閱讀
ComplexHeatmap包:個性化熱圖繪制利器

傳統(tǒng)機器學習方法和應(yīng)用指導

在上一篇文章中,我們介紹了機器學習的關(guān)鍵概念術(shù)語。在本文中,我們會介紹傳統(tǒng)機器學習的基礎(chǔ)知識和多種算....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 12-30 09:16 ?1145次閱讀
傳統(tǒng)機器學習方法和應(yīng)用指導

上海生物芯片有限公司榮獲“2024年上海市五一勞動獎狀”

5月13日,2024年上海市五一勞動獎表彰會暨先進事跡報告會在上海展覽中心友誼會堂隆重舉行,會議對榮....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 05-15 10:53 ?857次閱讀
上海生物芯片有限公司榮獲“2024年上海市五一勞動獎狀”

Quanterix宣布Tau217血液檢測被美國FDA授予 "突破性器械 "認證

3月4日,Quanterix宣布其Simoa磷酸化Tau217(p-Tau 217)血液檢測已被美國....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 03-12 17:23 ?2879次閱讀

復旦大學郝潔/鄒欣團隊Cell子刊發(fā)表單細胞分析新技術(shù)用于腫瘤精準免疫治療

為了解決這個問題,我們提出了scCURE,利用模式識別建模來區(qū)分免疫治療過程中發(fā)生變化和未發(fā)生變化的....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 12-29 16:54 ?1573次閱讀
復旦大學郝潔/鄒欣團隊Cell子刊發(fā)表單細胞分析新技術(shù)用于腫瘤精準免疫治療

對新輔助TCHP治療響應(yīng)的HER2+乳腺癌空間蛋白質(zhì)組特征

GeoMx IPA可以實現(xiàn)對組織中任何區(qū)域(如腫瘤區(qū)域、免疫交界區(qū)域、腫瘤微環(huán)境和正?;|(zhì)區(qū)域等)中....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 12-26 16:52 ?1262次閱讀
對新輔助TCHP治療響應(yīng)的HER2+乳腺癌空間蛋白質(zhì)組特征

SBC CosMx? SMI成功裝機,空間組學再升級

今年6月,SBC與NanoString攜手共建DSP空間組學“卓越中心”,引進GeoMx DSP,開....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 12-13 17:15 ?1573次閱讀
SBC CosMx? SMI成功裝機,空間組學再升級

百篇文獻匯總精華!單細胞高級分析(四)

上圖為各組細胞中regulons的RAS(regulon activity score)活性熱圖。行....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 12-11 17:11 ?1980次閱讀
百篇文獻匯總精華!單細胞高級分析(四)

用一篇20+文獻帶你領(lǐng)略修飾組學的魅力

利用LC+MS/MS DIA,對擬南芥野生型、AEL過表達和功能缺失ael突變體進行磷酸化蛋白質(zhì)組定....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 11-06 16:46 ?1760次閱讀
用一篇20+文獻帶你領(lǐng)略修飾組學的魅力

單細胞細胞注釋詳解之singleR細胞注釋

除了對每個細胞的所屬細胞類型進行評分外,singleR還會對seuret聚類結(jié)果中每個cluster....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 09-21 17:34 ?3119次閱讀
單細胞細胞注釋詳解之singleR細胞注釋

如何使用SBC ToolBox云平臺進行時間序列分析?

使用SBC ToolBox云平臺時間序列分析模塊探索基因集在不同時間點的表達趨勢,使用c-means....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 09-20 16:52 ?1633次閱讀
如何使用SBC ToolBox云平臺進行時間序列分析?

DSP助力同質(zhì)癌細胞進行藥物治療后的克隆命運研究

即使在基因相同的癌細胞中,對治療的抵抗也經(jīng)常出現(xiàn)在這些細胞的一小部分中。初始群體中稀有單個細胞的分子....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 09-02 14:56 ?1494次閱讀
DSP助力同質(zhì)癌細胞進行藥物治療后的克隆命運研究

Visium空間轉(zhuǎn)錄組和單細胞轉(zhuǎn)錄組的區(qū)別

空間轉(zhuǎn)錄組云平臺是SBCToolBox的一個VIP模塊,包括了數(shù)據(jù)的輸入、預(yù)覽、類群的展示、差異計算....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 08-30 10:48 ?5083次閱讀
Visium空間轉(zhuǎn)錄組和單細胞轉(zhuǎn)錄組的區(qū)別

基于精準聚焦目標空間區(qū)域的轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組一站式解決方案

空間多組學出現(xiàn)在世界經(jīng)濟論壇發(fā)布的年度最有潛力、對世界產(chǎn)生積極影響的十大技術(shù)中,絕非偶然。當我們在廣....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 08-29 11:10 ?1390次閱讀
基于精準聚焦目標空間區(qū)域的轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組一站式解決方案

DSP平臺助力揭示Y染色體丟失通過適應(yīng)性免疫逃逸來驅(qū)動腫瘤生長

為了確定為什么缺少Y染色體的膀胱癌更具侵襲性,研究人員接下來通過小鼠膀胱癌模型進行進一步研究。研究者....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 08-11 17:38 ?1679次閱讀
DSP平臺助力揭示Y染色體丟失通過適應(yīng)性免疫逃逸來驅(qū)動腫瘤生長

基于人類乳腺細胞圖譜中各細胞亞型之間的位置關(guān)系和空間聯(lián)系

? 人類細胞圖譜計劃(Human Cell Atlas,HCA)旨在描述人體中每個細胞(約37萬億個....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 07-23 15:02 ?1120次閱讀
基于人類乳腺細胞圖譜中各細胞亞型之間的位置關(guān)系和空間聯(lián)系

SBC ToolBox單細胞分析模塊上新組件了

添加指定類群間的差異篩選,您有多個樣本的數(shù)據(jù),想看下同一類群中不同樣本間的差異,用這個就夠了,可以幫....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 07-14 16:45 ?975次閱讀
SBC ToolBox單細胞分析模塊上新組件了

腦脊液磷酸t(yī)au T181和T217生物標志物在阿爾茨海默病診斷的臨床表現(xiàn)

? ? 介紹 阿爾茨海默病(AD)有兩個病理標志:β淀粉樣蛋白(Aβ)斑塊和tau神經(jīng)原纖維纏結(jié)。在....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 06-28 16:40 ?4634次閱讀
腦脊液磷酸t(yī)au T181和T217生物標志物在阿爾茨海默病診斷的臨床表現(xiàn)

DSP用于癌癥相關(guān)研究案例分享

? 癌癥早期發(fā)生過程,發(fā)展進程,腫瘤轉(zhuǎn)移,治療過程及耐藥等過程,以及新一代的腫瘤治療研究及解決方案,....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 06-27 16:34 ?957次閱讀
DSP用于癌癥相關(guān)研究案例分享

GeoMx DSP應(yīng)用領(lǐng)域

? 相信讀了上文(衰老與腫瘤研究利器:全新升級的GeoMx Digital Spatial Prof....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 06-19 16:46 ?949次閱讀

聚類分析中的機器學習與統(tǒng)計方法綜述(二)

次聚類是基因表達數(shù)據(jù)分析中應(yīng)用最廣泛的聚類方法。層次聚類在數(shù)據(jù)點之間構(gòu)建層次結(jié)構(gòu),它根據(jù)層次樹中的分....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 05-24 10:45 ?1784次閱讀
聚類分析中的機器學習與統(tǒng)計方法綜述(二)

聚類分析中的機器學習與統(tǒng)計方法綜述(一)

單細胞轉(zhuǎn)錄組測序(scRNA-seq)技術(shù)能夠?qū)毎褐械拿恳粋€細胞進行大規(guī)模的全轉(zhuǎn)錄組分析。
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 05-19 10:03 ?1394次閱讀
聚類分析中的機器學習與統(tǒng)計方法綜述(一)

CellTrek單細胞空間轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析

自單細胞測序技術(shù)橫空出世以來,由于其可以將測序縮小到單個細胞的單位內(nèi)進行,對于更加全面精確地了解生物....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 04-01 10:17 ?2611次閱讀

如何準確描述OCT切片方向呢?

空間轉(zhuǎn)錄組的主要魅力就在于能夠獲取轉(zhuǎn)錄組的空間位置信息,在進行空間轉(zhuǎn)錄組測序?qū)嶒灂r,首先需要獲取感興....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 02-20 11:48 ?1607次閱讀

timsTOF Pro質(zhì)譜儀助力微量樣本進行4D蛋白質(zhì)組學研究

蛋白質(zhì)作為功能分子,在生命活動中起到非常關(guān)鍵的作用。蛋白質(zhì)組學研究的最終目標是對整個組織或細胞蛋白質(zhì)....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 01-12 09:27 ?1786次閱讀

單細胞+轉(zhuǎn)錄組測序:揭示GABA信號調(diào)控神經(jīng)發(fā)生

為了探究復發(fā)CRC的細胞來源,本文研究者首先在單細胞水平分析了預(yù)后不良CRC患者的轉(zhuǎn)錄組特征,共確定....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 01-12 09:21 ?1191次閱讀

單細胞+轉(zhuǎn)錄組測序揭示GABA信號調(diào)控神經(jīng)發(fā)生

原發(fā)結(jié)直腸癌根治性切除術(shù)后的患者在幾年后復發(fā)轉(zhuǎn)移,轉(zhuǎn)移的CRC病理分期不一,其中會有40%的III期....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 01-12 09:19 ?1008次閱讀

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