SBC ToolBox單細(xì)胞分析模塊上新組件了

Arrow 展示組件

給您的UMAP & t-SNE 圖加箭頭坐標(biāo)，讓你的UMAP展示添加幾分靈動(dòng)，不再那么的枯燥無(wú)味。

自由定義類群顏色進(jìn)行展示；是不是看到選顏色已經(jīng)手足無(wú)措了，不用擔(dān)心， SBCToolBox默認(rèn)采用ggsci的配色，不去自定義顏色您的圖形展示也一樣可以清新脫俗；如果覺(jué)得還不滿意，您可以跳轉(zhuǎn)到https://www4.shbiochip.com/V2023/ColSp/ 網(wǎng)站去篩選您中意的顏色搭配，讓您的可視化結(jié)果更上一層樓。

上新第二彈

差異計(jì)算模塊組件

單個(gè)類群與其他類群的差異比較分析添加TopN基因篩選，可控范圍內(nèi)自由調(diào)節(jié)，篩選出每個(gè)類群的高表達(dá)marker基因，助您快速注釋細(xì)胞類型。

添加指定類群間的差異篩選，您有多個(gè)樣本的數(shù)據(jù)，想看下同一類群中不同樣本間的差異，用這個(gè)就夠了，可以幫您快速篩選出指定類群間的差異marker。

上新第三彈

篩選目標(biāo)類群組件

根據(jù)信息預(yù)覽的meta.data信息，篩選出目的Cluster或者目標(biāo)樣本，將目的細(xì)胞提取出來(lái)保存，如果是多個(gè)樣本，也可以根據(jù)樣本情況對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行拆分并保存。

上新第四彈

FeaturePlot 按列調(diào)整

根據(jù)基因展示數(shù)量情況，調(diào)整基因展示的列數(shù)，以達(dá)到FeaturePlot多行展示的目的。

上新第五彈

meta信息添加

您已經(jīng)對(duì)每個(gè)Cluster做好了細(xì)胞類型注釋，您可以先使用SBCToolBox的表格處理模塊對(duì)您的meta數(shù)據(jù)進(jìn)行合并注釋得到每個(gè)細(xì)胞barcode和細(xì)胞類型的注釋表格，如下圖：

鏈接：

https://www4.shbiochip.com/V2023/Sht/ShtC/

提交到注釋信息添加組件上，就可以輕松添加注釋信息。您的項(xiàng)目有多個(gè)樣本，對(duì)其進(jìn)行分組，也可以通過(guò)上述方式進(jìn)行注釋，注釋預(yù)覽如下，注釋完成，您可以下載rds文件進(jìn)行下一步分析。

完成細(xì)胞注釋后的展示：

這里需要重新提交注釋并保存的rds文件。修改默認(rèn)展示標(biāo)簽，即可完成分析，下圖展示了注釋完結(jié)果后的UMAP圖及新的細(xì)胞類型與樣本間的比例情況。