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基于Intel MIC平臺大規(guī)模耗散粒子動力學(xué)模擬的設(shè)計與優(yōu)化

2017-11-17 | rar | 0.62 MB | 次下載 | 免費

資料介紹

  耗散粒子動力學(xué)(DPD)模擬是一種重要的研究流體動力學(xué)特性的計算模擬方法,基于Intel MIC平臺設(shè)計實現(xiàn)了面向大規(guī)模耗散粒子動力學(xué)模擬,充分結(jié)合了DPD模擬本身的特性和MIC平臺的特征。對DPD模擬中的近鄰列表構(gòu)建和短程作用力關(guān)鍵代碼實現(xiàn)了向量化優(yōu)化,在CPU和MIC協(xié)處理器之間采用任務(wù)計算負載平衡機制,支持MPI進程內(nèi)線程數(shù)量負載平衡控制。分別在原型程序上和LAMMPS集成中做了性能對比分析,實驗結(jié)果顯示了引入相關(guān)優(yōu)化技術(shù)的有效性,為進一步研究面向MIC眾核平臺的分子動力學(xué)相關(guān)工作奠定了基礎(chǔ)。

基于Intel MIC平臺大規(guī)模耗散粒子動力學(xué)模擬的設(shè)計與優(yōu)化

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