Science雜志最新封面報(bào)道,科學(xué)家們成功掃描了果蠅的完整大腦,達(dá)到了納米級(jí)成像,將測(cè)繪速度提高了1000倍!有解讀大腦的能力,科學(xué)家就可以追蹤神經(jīng)元之間的聯(lián)系,從而破解大腦的奧秘。
大腦研究的新里程碑來(lái)了!
最新出版的Science雜志封面,報(bào)道了MIT和霍華德·休斯醫(yī)學(xué)研究所(HHMI)科學(xué)家們的最新成果,他們成功對(duì)果蠅的完整大腦進(jìn)行了成像,清晰度達(dá)到了納米級(jí),而且只用了不到三天時(shí)間!
幾十年來(lái),神經(jīng)科學(xué)家一直夢(mèng)想繪制出一幅完整的大腦神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的精細(xì)地圖,包括人腦、老鼠和果蠅的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)。有了這種能力,科學(xué)家就可以追蹤神經(jīng)元之間的聯(lián)系,進(jìn)而了解大腦是如何做出決定的。
利用電子顯微鏡對(duì)果蠅大腦的神經(jīng)元和突觸進(jìn)行全面測(cè)繪已經(jīng)花費(fèi)了10年的時(shí)間,數(shù)十人為此付出了努力??茖W(xué)家們通過(guò)結(jié)合兩種最先進(jìn)的技術(shù),膨脹顯微鏡(expansionmicroscopy)和晶格層光顯微鏡(lattice light-sheet microscope),新的大腦測(cè)繪速度提高了1000倍。
值得注意的是,發(fā)明了晶格層光顯微術(shù)的Eric Betzig教授獲得2014年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng),這次登上Science封面的論文,也有Eric Betzig的名字。
Eric Betzig教授
論文的通訊作者M(jìn)IT教授Edward S. Boyden五年前發(fā)明了膨脹顯微鏡,并在2018年獲得了有諾貝爾風(fēng)向標(biāo)稱(chēng)號(hào)的加拿大蓋爾德納獎(jiǎng)(Canada Gairdner International Award)。
Edward S. Boyden教授
這篇論文堪稱(chēng)是兩個(gè)頂級(jí)研究團(tuán)隊(duì)“珠簾合璧”的力作。
納米級(jí)觀察大腦:4000萬(wàn)個(gè)突觸一覽無(wú)余
電子顯微鏡一直是研究大腦的利器,這也是幾代人努力之后探索出來(lái)的一條道路。不過(guò),使用電子顯微鏡,需要花費(fèi)多年的時(shí)間才能獲得果蠅的大腦圖像。
Science最新一期的封面,介紹了一種新的大腦掃描技術(shù),能讓任何人看清果蠅大腦的4000萬(wàn)個(gè)突觸,其中神經(jīng)元相互連接。
動(dòng)圖:MIT的研究人員開(kāi)發(fā)了一種對(duì)腦組織進(jìn)行大規(guī)模3D成像的方法,他們描繪了果蠅的整個(gè)大腦。 來(lái)源: MIT
這項(xiàng)研究的里程碑意義在于,這張覆蓋整個(gè)果蠅大腦的3D地圖顯示出直徑只有60納米的細(xì)節(jié),而且只用了不到三天時(shí)間,果蠅大腦中不同的神經(jīng)細(xì)胞,甚至蛋白質(zhì)在空間上的相對(duì)分布都能夠看到,這對(duì)基礎(chǔ)科研意義重大。
雖然其細(xì)節(jié)水平不如電子顯微鏡觀察到的那么好,但通過(guò)計(jì)算突觸,神經(jīng)科學(xué)家可以判斷神經(jīng)連接的強(qiáng)度,比如那些負(fù)責(zé)記憶的神經(jīng)連接。
2014年獲諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)的Eric Betzig教授說(shuō),一天至少能掃描10個(gè)果蠅的大腦,這樣的快速和高分辨率將促使科學(xué)家們提出新的問(wèn)題,比如雄性和雌性果蠅的大腦有哪些差異,或者同種果蠅的大腦回路有什么差別。
并且,這只是昆蟲(chóng)大腦復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)連接的超分辨率視圖,這些網(wǎng)絡(luò)連接構(gòu)成了從進(jìn)食到交配的各種行為的基礎(chǔ),今后,掃描更高級(jí)生物的大腦,是不是可以期待一下呢?
膨脹顯微鏡和晶格層光顯微鏡珠簾合璧之作
MIT的Edward Boyden教授在五年前發(fā)明膨脹顯微鏡(expansion microscopy),他說(shuō):“我們不僅僅是在逐步掃描更多的腦組織,我們是在掃描整個(gè)大腦。這就是我們?nèi)绱伺d奮的原因?!?/p>
小鼠初級(jí)軀體感覺(jué)皮層中的錐體神經(jīng)元(橙色部分),與突觸后蛋白Homer1相關(guān)的樹(shù)突棘用黃色突出顯示。來(lái)源: MIT
Boyden教授將膨脹顯微技術(shù)與Betzig的最新晶格層光顯微鏡技術(shù)結(jié)合起來(lái),研究出了這項(xiàng)新的腦部掃描技術(shù)。
膨脹顯微鏡(ExM)的原理是將組織樣本包埋在一種吸水膨脹的聚合物中,使得組織像氣球一樣膨脹,同時(shí)能保持內(nèi)部結(jié)構(gòu)的相對(duì)位置不變,然后用常規(guī)顯微鏡對(duì)大塊腦組織進(jìn)行了超高分辨率的蛋白質(zhì)成像。它使用的是類(lèi)似尿不濕里的聚丙烯酰胺凝膠,這種凝膠在從鹽水轉(zhuǎn)移到純凈水的過(guò)程中會(huì)膨脹。
將果蠅的大腦擴(kuò)大到正常大小的四倍后,科學(xué)家們利用晶格層光顯微鏡對(duì)所有多巴胺能神經(jīng)元(綠色)進(jìn)行成像。來(lái)源:Credit: Gaoet al./Science2019
晶格層光顯微鏡(LLSM)則使用高度聚焦的光束,一次一個(gè)薄片地快速合成一個(gè)樣本的三維圖像。
Betzig說(shuō):“(Boyden)他們2016年第一次來(lái)找我時(shí),我還是充滿(mǎn)懷疑的;我擔(dān)心的是,首先,你是否可以使大腦組織這樣的東西理想地膨脹,而不讓它產(chǎn)生扭曲。然后我擔(dān)心,盡管樣品是透明的,它們還是會(huì)像玻璃球那樣扭曲光線(xiàn)?!?/p>
瀏覽果蠅大腦的高分辨率3D圖像。這些彩色的球代表了大腦中神經(jīng)元的一個(gè)子集上突觸的密度,即那些對(duì)多巴胺有反應(yīng)的神經(jīng)元。這些彩色小球總共繪制了整個(gè)大腦的4000萬(wàn)個(gè)突觸其中50萬(wàn)個(gè)突觸的位置,紅色表示突觸密度最高,紫色表示突觸密度最低。不同的大腦結(jié)構(gòu)被突出顯示。視頻來(lái)源:HHMI,UC Berkeley
果蠅大腦橢球體中的多巴胺能神經(jīng)元,用3D深度進(jìn)行顏色編碼。來(lái)源:MIT
該聯(lián)合研究團(tuán)隊(duì)由MIT Boyden實(shí)驗(yàn)室的博士后Ruixuan Gao和 Shoh Asano,以及哈佛醫(yī)學(xué)院的Srigokul Upadhyayula帶領(lǐng),他們發(fā)現(xiàn),在將腦組織膨脹4倍,體積增大到64倍后,它就幾乎和水一樣清澈,不會(huì)產(chǎn)生變形。
Boyden說(shuō):“我很驚訝地發(fā)現(xiàn),它的清晰度是如此完美,呈現(xiàn)出令人難以置信的光學(xué)均勻性?!?/p>
結(jié)果,這種晶格層光顯微鏡能夠在單個(gè)突觸的水平上拍攝出一張非常詳細(xì)且精確的大腦圖像:分辨率達(dá)到約60納米,僅為電子顯微鏡分辨率的十分之一。多色成像只需62.5小時(shí)。
我們的征程是星辰大“腦”
不過(guò),Betzig預(yù)測(cè),隨著膨脹顯微鏡技術(shù)的改進(jìn)——一些科學(xué)家已經(jīng)能在每個(gè)方向?qū)⒔M織伸長(zhǎng)25倍——這種結(jié)合技術(shù)在繪制大腦中所有神經(jīng)連接方面可以取得幾乎和電子顯微鏡一樣好的結(jié)果。
“如果你能讓它在10倍或15倍的膨脹程度有效運(yùn)作,科學(xué)家可能就會(huì)拋棄電子顯微鏡了。電子顯微鏡做密集神經(jīng)跟蹤也很好,但我們的技術(shù)要快得多,也便宜得多。我認(rèn)為他們需要擔(dān)心。盡管現(xiàn)在還不能取代電子顯微鏡,但在我看來(lái),是有這種潛力的。”
每一次完整的掃描,總計(jì)產(chǎn)生接近10TB的數(shù)據(jù),然后由計(jì)算機(jī)組合成一個(gè)可以像視頻游戲一樣導(dǎo)航的3D圖像。
通過(guò)將熒光標(biāo)記物附著到大腦中的蛋白質(zhì)上,就有可能繪制出神經(jīng)元和其他細(xì)胞的外膜、一個(gè)神經(jīng)元與另一個(gè)神經(jīng)元連接的突觸、腦細(xì)胞的內(nèi)部隔間,等等。
一小部分錐體神經(jīng)元(黃色),以及與小鼠初級(jí)軀體感覺(jué)皮層中神經(jīng)元相關(guān)的突觸前(青色)和突觸后(洋紅色)蛋白質(zhì)對(duì)。來(lái)源:MIT
這一研究為神經(jīng)科學(xué)帶來(lái)了極為重要的研究工具,幫助科學(xué)家們理解不同的神經(jīng)環(huán)路如何組成,性別對(duì)大腦有怎樣的影響,疾病又會(huì)怎樣破壞大腦等等。
研究團(tuán)隊(duì)不僅對(duì)果蠅的整個(gè)大腦進(jìn)行了測(cè)試,還對(duì)老鼠大腦皮層上幾毫米厚的一個(gè)薄片組織進(jìn)行了測(cè)試,結(jié)果類(lèi)似。
人類(lèi)的大腦有800億個(gè)神經(jīng)元,每個(gè)神經(jīng)元可能有7000個(gè)突觸,這或許是團(tuán)隊(duì)的新挑戰(zhàn)。
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原文標(biāo)題:Science封面里程碑研究!納米級(jí)成像,人類(lèi)終于看清大腦每個(gè)神經(jīng)元
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