基于biosql構(gòu)建了分子生物學(xué)二次數(shù)據(jù)庫(kù)

　　在生物信息學(xué)中，建立生物二次數(shù)據(jù)庫(kù)可以針對(duì)特定物種進(jìn)行更深入的研究。針對(duì)分子生物學(xué)二次數(shù)據(jù)庫(kù)資源平臺(tái)的構(gòu)建的迫切需要，利用biosql構(gòu)建了分子生物學(xué)二次數(shù)據(jù)庫(kù)，運(yùn)用tomcat 6.0+ Myeclipse+mysql技術(shù)，MVC開(kāi)發(fā)模式，實(shí)現(xiàn)了以抗逆基因?yàn)槔膚eb資源數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái)。該平臺(tái)解決了分子生物二次數(shù)據(jù)庫(kù)的構(gòu)建與抗逆基因數(shù)據(jù)自動(dòng)獲取，能及時(shí)接受研究者數(shù)據(jù)的上傳和抗逆基因的快速檢索。該平臺(tái)同樣可以應(yīng)用到其他類別的分子生物，加快了對(duì)某一范圍內(nèi)分子生物學(xué)的研究，使研究更具針對(duì)性。

　　生物信息學(xué)就其本身字面意義是所有關(guān)于生物的信息研究的學(xué)科。但是一般意義上的生物信息學(xué)就專門(mén)指關(guān)于分子水平的各種生物大分子序列、結(jié)構(gòu)和功能上的信息研究。分子生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)主要包括基因組數(shù)據(jù)庫(kù)、核酸和蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)、蛋白質(zhì)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)等初始數(shù)據(jù)庫(kù)，以及由此而構(gòu)建的二次數(shù)據(jù)庫(kù)、復(fù)合數(shù)據(jù)庫(kù)，即面向生物學(xué)家具有各種不同特色或特殊用途的專門(mén)數(shù)據(jù)庫(kù)。自人類基因組計(jì)劃從20世紀(jì)90年代開(kāi)始啟動(dòng)后，對(duì)分子生物研究與日俱增，然而相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)資源平臺(tái)卻屈指可數(shù)。一般而言，生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)可以分為一級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)和二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)。一級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)的教據(jù)都直接來(lái)源于實(shí)驗(yàn)獲得的原始數(shù)據(jù)，只經(jīng)過(guò)簡(jiǎn)單的歸類整理和注釋。國(guó)際上著名的三大核酸數(shù)據(jù)庫(kù)NCBI的Genebank、日本的DDBJ和EBI的EMBL數(shù)據(jù)庫(kù)都是建立二次數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)來(lái)源。BioPerl作為Perl語(yǔ)言專門(mén)用于生物信息的工具與函數(shù)模塊集，是世界各地的perl開(kāi)發(fā)在生物信息學(xué)、基因組學(xué)以及其他生命科學(xué)領(lǐng)域的智能結(jié)晶。利用BioPerl構(gòu)建分子數(shù)據(jù)庫(kù)是研究人員廣泛使用的方法，已經(jīng)形成了行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)。