谷歌(Google)旗下的人工智能團隊DeepMind所開發(fā)的AlphaFold系統(tǒng)日前在世界蛋白質模型預測競賽中排名第一。蛋白質折疊模型的準確預測,對攻克人類多種疾病有重要意義。該團隊開發(fā)的圍棋人工智能系統(tǒng)AlphaGo曾在兩年前擊敗所有來自世界各國的人類棋王。
蛋白質折疊(protein folding)是蛋白質獲得其功能性結構和構象的過程。通常蛋白質自然呈能量高效狀態(tài),但有時會出現(xiàn)錯誤。像糖尿病、帕金森氏病、老年失智(Alzheimer’s disease)癥等都與蛋白質出錯相關。
如果科學家能從其化學成分準確預測蛋白質的三維構象,就能設計治療各種疾病的新蛋白質,還能解決很多棘手問題,比如分解現(xiàn)在嚴重的塑料污染等。
然而要獲得蛋白質三維構象猶如一個破譯密碼的過程,需要耗費研究者們很長的時間。這種情況下,人工智能往往是人類的好幫手。
由美國常規(guī)醫(yī)學科學研究所(NIGMS)出資的“結構預測關鍵評估”大賽(CASP)是一年兩次的預測蛋白質折疊結構的奧林匹克賽,吸引著世界各地研究團隊的參與。
在為期數(shù)月的競賽期間,組織方每幾天向參加的團隊發(fā)去一些氨基酸清單,參與者從這些氨基酸預測蛋白質結構。這些“考題”是近期通過傳統(tǒng)的方法,耗費了大量的人力物力資源才得到的蛋白質結構。
上周末在墨西哥坎昆(Cancun),競賽舉辦方宣布谷歌的人工智能系統(tǒng)AlphaFold在98個參與團隊中積分排名第一。AlphaFold準確預測了43種蛋白質中25個的結構;排名第二的團隊預測了其中3個。
AlphaFold以其先進的算法,花了兩周時間破譯第一個蛋白質結構,但之后每個只需數(shù)小時時間。
英國學術團隊中積分最高的英國雷丁大學(University of Reading)小組的領隊研究員Liam McGuffin說:“預測任何蛋白質折疊形狀的能力很重要,對解決21世紀很多問題有重要作用,對健康、生態(tài)、環(huán)境和任何生命系統(tǒng)相關的問題都有影響。”
McGuffin還說,包括他們在內很多團隊多年來都在研究人工智能在這個領域的使用,他認為這個領域有望在本世紀20年代征服蛋白質預測問題。
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原文標題:人工智能里程碑 AlphaFold準確預測蛋白質模型
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