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便攜式集成微流控生物芯片用于B組鏈球菌快速診斷

MEMS ? 來源:MEMS ? 2023-12-12 09:24 ? 次閱讀

B組鏈球菌(Group B Streptococcus, GBS)是產(chǎn)后感染和新生兒感染中重要病原菌之一。特別是在妊娠過程中,可導(dǎo)致孕婦的早產(chǎn)、宮內(nèi)感染等并發(fā)癥;在分娩期間也可能會導(dǎo)致新生兒敗血癥、腦膜炎或肺炎等一系列感染,是全球新生兒侵襲性感染的主要原因。每年導(dǎo)致9.1萬名新生兒死亡,4.6萬多名死產(chǎn)和4萬名感染后患有神經(jīng)殘疾的新生兒。因此,快速準確地診斷孕婦GBS對預(yù)防新生兒感染至關(guān)重要。對于城市或者城鎮(zhèn)醫(yī)院,已經(jīng)實現(xiàn)了基于規(guī)范化的實驗室的GBS普篩。但對于資源有限的偏遠鄉(xiāng)村地區(qū)的衛(wèi)生院及婦幼保健院,由于缺乏訓(xùn)練有素的技術(shù)人員,以及額外的、高成本的儀器,GBS的快速診斷存在諸多挑戰(zhàn)。

據(jù)麥姆斯咨詢報道,針對上述需求,北京航空航天大學(xué)常凌乾課題組在《Biosensors & Bioelectronics》(IF: 12.7)期刊上發(fā)表了題為“A portable, integrated microfluidics for rapid and sensitive diagnosis of streptococcus agalactiae in resource-limited environments”的研究文章,設(shè)計了一種便攜式集成微流控生物芯片,可以快速提取樣本拭子中的DNA,并進行快速擴增,最后通過試紙條可視化的讀取結(jié)果,整個流程控制在40分鐘以內(nèi)。與傳統(tǒng)的NAAT(6小時)不同,該平臺是一種簡單、便攜、無電源的微流控平臺,僅通過簡單的手指擠壓操作,即可在1小時內(nèi)完成DNA提取、富集、純化、擴增和檢測的整個過程,因此非常適合中心實驗室以外的各種場景。

作為革蘭氏陽性菌,GBS具有特有的細胞壁和莢膜結(jié)構(gòu),給傳統(tǒng)DNA提取方法帶來了額外的挑戰(zhàn)。針對此,研究人員設(shè)計了一步法DNA提取管,用PDMS隔片將提取管分成兩個獨立的區(qū)域,分別裝載樣本稀釋液和核酸裂解液。在操作中,被試者將取樣拭子放入稀釋液中釋放病原體,然后輕輕撥動PDMS隔片,使稀釋劑流向下方含有玻璃珠的裂解液。通過簡單地用手搖動提取管,并在提供的便攜式加熱裝置中加熱10分鐘,即可釋放DNA。

生物芯片平臺由三個功能區(qū)組成,包括DNA富集區(qū)、DNA擴增區(qū)和檢測區(qū)。通過使用設(shè)計的彈性軟管,擠壓軟管產(chǎn)生顯著的驅(qū)動力,將預(yù)包裝的相應(yīng)緩沖液,包括裂解緩沖液(A-軟管)、洗滌緩沖液(B-軟管)、RPA緩沖液(C-軟管)、運行緩沖液(D-軟管)分別推入設(shè)備中的相應(yīng)部位,產(chǎn)生不同的功能。在操作時擠壓A-軟管,驅(qū)動含有GBS DNA的液體流入富集區(qū),DNA被預(yù)先填充的磁珠捕獲。并且,磁珠被生物芯片下面的磁鐵捕獲,使DNA固定在擴增區(qū)。其余的液體被收集在廢液池中;第二步,擠壓B-軟管,洗滌去除磁珠表面的雜質(zhì)(包括各種蛋白質(zhì)和離子);第三步,擠壓C-軟管,使RPA緩沖液進入擴增區(qū),在38℃下進行快速擴增;最后,擠壓D-軟管,將擴增溶液驅(qū)動到試紙條上,以讀出結(jié)果。在試紙條上,在檢測線(T線)上修飾鏈霉親和素,在質(zhì)控線(C線)上修飾二抗,可以捕獲RPA體系中特異性探針的生物素和FAM基團,與膠體金形成“三明治”結(jié)構(gòu),顯示紅色條帶,表示陽性反應(yīng)。

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圖1 用于GBS快速診斷的生物芯片的設(shè)計理念和運行過程的原理示意圖

考慮到這樣一個簡單、便攜、可重復(fù)使用的設(shè)備可以用于中心實驗室以外的場景,該課題組設(shè)計了一個可重復(fù)使用的便攜式加熱裝置作為平臺附件。該裝置由4根彈性軟管組成,軟管內(nèi)裝有相應(yīng)的緩沖液(裂解緩沖液、洗滌緩沖液、RPA緩沖液、運行緩沖液),依次完成核酸提取、富集/純化、擴增和讀出過程。核心加熱功能由電池供電,控制加熱板,單次反應(yīng)持續(xù)加熱約40分鐘,分別用于DNA提取的95℃,和RPA反應(yīng)的38℃。

研究團隊在中國甘肅省婦幼保健院(甘肅省中心醫(yī)院)進行了47例患者的陰道和肛門拭子樣本檢測。通過比較qPCR實驗室結(jié)果與PIM平臺的顯色反應(yīng),發(fā)現(xiàn)qPCR結(jié)果與新技術(shù)具有相同的靈敏度。最終,47例臨床樣本顯示,平臺靈敏度達到100%,與臨床PCR結(jié)果一致。

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圖2 在臨床診斷中的應(yīng)用

該研究通訊作者為北航生物醫(yī)學(xué)工程常凌乾教授、甘肅省中心醫(yī)院易彬教授、甘肅省腫瘤醫(yī)院蘇海翔教授。第一作者是北航博士生王之瑩,甘肅省中心醫(yī)院晏博博士、倪亞莉主任為共同第一作者。






審核編輯:劉清

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