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借助NVIDIA AI計算平臺可更高效利用前沿生物技術與AI

科技綠洲 ? 來源:NVIDIA英偉達 ? 作者:NVIDIA英偉達 ? 2022-05-11 14:25 ? 次閱讀

百圖生科(BioMap)是一家生物計算驅動的生命科學平臺公司,致力于將先進 AI 技術與前沿生物技術相結合,構建獨特的靶點挖掘及藥物設計能力,開發(fā)創(chuàng)新的藥物和診斷產(chǎn)品。

利用生物計算引擎,加速對復雜疾病機理的發(fā)現(xiàn)進程,從而提升生命科學研發(fā)的效率。

百圖生科基于 NVIDIA DGX A100 80GB 和自身龐大的計算能力,構建獨特的生物計算引擎,提高了計算密度、性能和靈活性。

亟需優(yōu)化網(wǎng)絡環(huán)境,解決數(shù)據(jù)科學問題

為了開發(fā)和整合多種先進的 AI 算法芯片,傳感器,多組學分析,類器官模擬等技術,構建獨特的生物計算引擎,建立高質量、高效率的靶點篩查和藥物設計能力,構建基于高維度多組學、高通量干濕試驗閉環(huán)、高精準抗體設計、高性能生物計算平臺能力,百圖生科希望利用生物計算引擎,構建強大的 AI 技術及計算平臺和前沿生物技術平臺,希望開發(fā)針對生物計算需求的超級計算集群、高性能蛋白質計算芯片、高性能圖數(shù)據(jù)庫、高等級的數(shù)據(jù)安全與隱私計算引擎,支撐 EB 級別的海量數(shù)據(jù)存儲計算需求,比如超大規(guī)模的蛋白質預訓練模型、圖神經(jīng)網(wǎng)絡靶點分析、蛋白質結構預測和模擬。通過強大的算力服務器支持,可以幫助實現(xiàn)快速解決更龐大、更復雜的數(shù)據(jù)科學問題,更好地建立生物計算引擎和強大的 AI 技術及計算平臺。

網(wǎng)絡改造,提高跨節(jié)點使用效率

基于以上挑戰(zhàn),百圖生科采用了 NVIDIA DGX A100 80GB,將深度學習訓練、推理和分析整合至一個易于部署的統(tǒng)一 AI 基礎架構中,擁有一個更簡單快捷的解決人工智能的方法。

百圖生科參考了 DGX A100 的標準架構和網(wǎng)絡互聯(lián)建議,決定按標準建議進行網(wǎng)絡改造,采用了 NVIDIA 網(wǎng)絡交換機,其中將 NVIDIA InfiniBand QM 8700 做計算互聯(lián),NVIDIA Ethernet MSN3700 做存儲和管理網(wǎng)絡,可以讓整個集群全線速計算,提高跨節(jié)點使用效率。

更高效利用前沿生物技術與 AI

當前生物醫(yī)藥行業(yè)普遍面臨一個非常嚴峻的問題,即“雙十定律”,具體來說就是一款新藥從研發(fā)到上市,平均需要 10 年時間和 10 億美元的投入,且成功率不足 10%。越來越多的醫(yī)藥企業(yè)在尋求如何利用人工智能技術提高行業(yè)的運行效率。

當前基因技術的發(fā)展已經(jīng)進入到數(shù)據(jù)爆發(fā)式增長的階段,隨著更多組學數(shù)據(jù)的不斷積累,包括血液、組織、器官等宏觀系統(tǒng)的連續(xù)觀測數(shù)據(jù)的結構化都在逐漸成熟之中;人工智能新的算法應用也涉及到了很多領域,如無人駕駛、人臉識別、復雜的知識圖譜構建等;成熟的云計算服務也在為各行各業(yè)的轉型發(fā)展提供強大的算力支持,AI 技術賦能生物制藥行業(yè)加快發(fā)展的基本條件都已具備。

“作為生物計算引擎驅動的創(chuàng)新藥物研發(fā)平臺,借助 NVIDIA AI 計算平臺,在蛋白質結構預測、親和力預測等場景,NVIDIA DGX A100 相比其他硬件解決方案計算性能提升了 10-20 倍。百圖生科將更高效地利用前沿生物技術 + AI,解決生命科學行業(yè)的高價值問題,攜手行業(yè)伙伴打造創(chuàng)新藥物管線,助力人類健康事業(yè)發(fā)展?!卑賵D生科副總裁周達表示。

審核編輯:彭靜
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