加速生命科學(xué)計算,賦能下一代新藥研發(fā)
近日,專用計算芯片研發(fā)與算力解決方案創(chuàng)新企業(yè)雪湖科技在全球超過55家參賽企業(yè)中脫穎而出,憑借“面向新藥研發(fā)的生命科學(xué)計算專用超算Yaddle”榮獲由賽靈思舉辦的“全球自適應(yīng)計算挑戰(zhàn)賽(Adaptive Computing Challenge 2020)”亞軍,這也是中國區(qū)及生命科學(xué)領(lǐng)域的唯一獲獎企業(yè)?!癥addle”由雪湖科技自主設(shè)計開發(fā),賦能下一代基于動態(tài)的藥物設(shè)計(motion-based drug design)。
雪湖科技獲“全球自適應(yīng)計算挑戰(zhàn)賽”亞軍
傳統(tǒng)新藥研發(fā)主要基于蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu),這一過程類似于“看照片”,僅能根據(jù)生物分子的靜態(tài)結(jié)構(gòu)猜測藥物與靶點的結(jié)合,成功率低。近年來,基于蛋白質(zhì)四維動力學(xué)的藥物設(shè)計方法為新藥研發(fā)提供了更多可能性。通過“看視頻”,研發(fā)人員能清晰觀察并深入了解生物分子的動態(tài)變化,發(fā)現(xiàn)藥物與生物分子之間的作用路徑。分子動力學(xué)模擬將成為下一代新藥研發(fā)的必備工具。
從“看照片”到“看視頻”,大規(guī)模分子動力學(xué)計算對算力提出了巨大挑戰(zhàn)。憑借在專用計算芯片領(lǐng)域深厚的積累,雪湖科技基于賽靈思強(qiáng)大的FPGA芯片,打造了“生命科學(xué)專用超算Yaddle”,助力藥物設(shè)計邁入“看視頻”的時代,縮短新藥研發(fā)周期,降低新藥研發(fā)風(fēng)險,進(jìn)一步提升藥物發(fā)現(xiàn)的效率。“Yaddle”同時兼容常用分子動力學(xué)軟件,助力新藥研發(fā)從基于結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計(structure-based drug design)升級到下一代基于動態(tài)的藥物設(shè)計(motion-based drug design)。
“面向新藥研發(fā)的生命科學(xué)計算專用超算Yaddle”系統(tǒng)架構(gòu)
雪湖科技生命科學(xué)計算首席科學(xué)家盛楠博士表示:“目前,所有藥物的靶向蛋白質(zhì)在基因上占比僅5%,仍有大量疾病相關(guān)蛋白質(zhì)沒有靶向藥物,甚至有很多疾病的致病機(jī)理尚不清晰。隨著新藥研發(fā)步入‘算力時代’,雪湖科技計劃在年內(nèi)實現(xiàn)‘Yaddle’的正式商用,并歡迎新藥研發(fā)領(lǐng)域企業(yè)攜手合作,利用下一代基于動態(tài)的藥物設(shè)計(motion-based drug design)加速新藥研發(fā)過程,為患者的生命健康帶去福音?!?/p>
“全球自適應(yīng)計算挑戰(zhàn)賽2020”由賽靈思舉辦,賽事從2020年夏季啟動,吸引了全球頂尖FPGA開發(fā)者與創(chuàng)新企業(yè)參加,比拼如何借助賽靈思硬件平臺以創(chuàng)新技術(shù)解決現(xiàn)實問題。
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