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結(jié)合阿里云上的EMR JindoFS優(yōu)化和實踐,數(shù)據(jù)湖怎么玩“加速”?

lhl545545 ? 來源:51cto ? 作者:阿里技術(shù) ? 2020-09-16 11:56 ? 次閱讀

湖加速即為數(shù)據(jù)湖加速,是指在數(shù)據(jù)湖架構(gòu)中,為了統(tǒng)一支持各種計算,對數(shù)據(jù)湖存儲提供適配支持,進行優(yōu)化和緩存加速的中間層技術(shù)。那么為什么需要湖加速?數(shù)據(jù)湖如何實現(xiàn)“加速”?本文將從三個方面來介紹湖加速背后的原因,分享阿里云在湖加速上的實踐經(jīng)驗和技術(shù)方案。

在開源大數(shù)據(jù)領(lǐng)域,存儲/計算分離已經(jīng)成為共識和標準做法,數(shù)據(jù)湖架構(gòu)成為大數(shù)據(jù)平臺的首要選擇?;谶@一范式,大數(shù)據(jù)架構(gòu)師需要考慮三件事情:

第一,選擇什么樣的存儲系統(tǒng)做數(shù)據(jù)湖(湖存儲)? 第二,計算和存儲分離后,出現(xiàn)了性能瓶頸,計算如何加速和優(yōu)化(湖加速)? 第三,針對需要的計算場景,選擇什么樣的計算引擎(湖計算)?

湖存儲可以基于我們熟悉的HDFS,在公共云上也可以選擇對象存儲,例如阿里云OSS。在公共云上,基于對象存儲構(gòu)建數(shù)據(jù)湖是目前業(yè)界最主流的做法,我們這里重點探討第二個問題,結(jié)合阿里云上的EMR JindoFS優(yōu)化和實踐,看看數(shù)據(jù)湖怎么玩“加速”。

湖加速

在數(shù)據(jù)湖架構(gòu)里,湖存儲(HDFS,阿里云OSS)和湖計算(Spark,Presto)都比較清楚。那么什么是湖加速?大家不妨搜索一下…(基本沒有直接的答案)。湖加速是阿里云EMR同學(xué)在內(nèi)部提出來的,顧名思義,湖加速即為數(shù)據(jù)湖加速,是指在數(shù)據(jù)湖架構(gòu)中,為了統(tǒng)一支持各種計算,對數(shù)據(jù)湖存儲提供適配支持,進行優(yōu)化和緩存加速的中間層技術(shù)。這里面出現(xiàn)較早的社區(qū)方案應(yīng)該是Alluxio,Hadoop社區(qū)有S3A Guard,AWS有EMRFS,都適配和支持AWS S3,Snowflake在計算側(cè)有SSD緩存,Databricks有DBIO/DBFS,阿里云有EMR JindoFS,大體都可以歸為此類技術(shù)。

那么為什么需要湖加速呢?這和數(shù)據(jù)湖架構(gòu)分層,以及相關(guān)技術(shù)演進具有很大關(guān)系。接下來,我們從三個方面的介紹來尋找答案。分別是:基礎(chǔ)版,要適配;標配版,做緩存;高配版,深度定制。JindoFS同時涵蓋這三個層次,實現(xiàn)數(shù)據(jù)湖加速場景全覆蓋。

基礎(chǔ)版:適配對象存儲

以Hadoop為基礎(chǔ)的大數(shù)據(jù)和在AWS上以EC2/S3為代表的云計算,在它們發(fā)展的早期,更像是在平行的兩個世界。等到EMR產(chǎn)品出現(xiàn)后,怎么讓大數(shù)據(jù)計算(最初主要是MapReduce)對接S3,才成為一個真實的技術(shù)命題。對接S3、OSS對象存儲,大數(shù)據(jù)首先就要適配對象接口。Hadoop生態(tài)的開源大數(shù)據(jù)引擎,比如Hive和Spark,過去主要是支持HDFS,以Hadoop Compatible File System(HCFS)接口適配、并支持其他存儲系統(tǒng)。機器學(xué)習(xí)生態(tài)(Python)以POSIX接口和本地文件系統(tǒng)為主,像TensorFlow這種深度學(xué)習(xí)框架當然也支持直接使用HDFS 接口。對象存儲產(chǎn)品提供REST API,在主要開發(fā)語言上提供封裝好的SDK,但都是對象存儲語義的,因此上述這些流行的計算框架要用,必須加以適配,轉(zhuǎn)換成HCFS接口或者支持POSIX。這也是為什么隨著云計算的流行,適配和支持云上對象存儲產(chǎn)品成為Hadoop社區(qū)開發(fā)的一個熱點,比如S3A FileSytem。阿里云EMR團隊則大力打造JindoFS,全面支持阿里云OSS并提供加速優(yōu)化。如何高效地適配,并不是設(shè)計模式上增加一層接口轉(zhuǎn)換那么簡單,做好的話需要理解兩種系統(tǒng)(對象存儲和文件系統(tǒng))背后的重要差異。我們稍微展開一下:

第一,海量規(guī)模。

對象存儲提供海量低成本存儲,相比文件系統(tǒng)(比如HDFS),阿里云OSS更被用戶認為可無限擴展。同時隨著各種BI技術(shù)和AI技術(shù)的流行和普及,挖掘數(shù)據(jù)的價值變得切實可行,用戶便傾向于往數(shù)據(jù)湖(阿里云OSS)儲存越來越多不同類型的數(shù)據(jù),如圖像、語音、日志等等。這在適配層面帶來的挑戰(zhàn)就是,需要處理比傳統(tǒng)文件系統(tǒng)要大許多的數(shù)據(jù)量和文件數(shù)量。千萬級文件數(shù)的超大目錄屢見不鮮,甚至包含大量的小文件,面對這種目錄,一般的適配操作就失靈了,不是OOM就是hang在那兒,根本就不可用。JindoFS一路走來積累了很多經(jīng)驗,我們對大目錄的listing操作和du/count這種統(tǒng)計操作從內(nèi)存使用和充分并發(fā)進行了深度優(yōu)化,目前達到的效果是,千萬文件數(shù)超大目錄,listing操作比社區(qū)版本快1倍,du/count快21%,整體表現(xiàn)更為穩(wěn)定可靠。

第二,文件和對象的映射關(guān)系。

對象存儲提供key到blob對象的映射,這個key的名字空間是扁平的,本身并不具備文件系統(tǒng)那樣的層次性,因此只能在適配層模擬文件/目錄這種層次結(jié)構(gòu)。正是因為要靠模擬,而不是原生支持,一些關(guān)鍵的文件/目錄操作代價昂貴,這里面最為知名的就是rename了。文件rename或者mv操作,在文件系統(tǒng)里面只是需要把該文件的inode在目錄樹上挪動下位置即可,一個原子操作;但是在對象存儲上,往往受限于內(nèi)部的實現(xiàn)方式和提供出來的標準接口,適配器一般需要先copy該對象到新位置,然后再把老對象delete掉,用兩個獨立的步驟和API調(diào)用。對目錄進行rename操作則更為復(fù)雜,涉及到該目錄下的所有文件的rename,而每一個都是上述的copy+delete;如果目錄層次很深,這個rename操作還需要遞歸嵌套,涉及到數(shù)量巨大的客戶端調(diào)用次數(shù)。對象的copy通常跟它的size相關(guān),在很多產(chǎn)品上還是個慢活,可以說是雪上加霜。阿里云OSS在這方面做了很多優(yōu)化,提供Fast Copy能力,JindoFS充分利用這些優(yōu)化支持,結(jié)合客戶端并發(fā),在百萬級大目錄rename操作上,性能比社區(qū)版本接近快3X。

第三,一致性。

為了追求超大并發(fā),不少對象存儲產(chǎn)品提供的是最終一致性(S3),而不是文件系統(tǒng)常見的強一致性語義。這帶來的影響就是,舉個栗子,程序明明往一個目錄里面剛剛寫好了10個文件,結(jié)果隨后去list,可能只是部分文件可見。這個不是性能問題,而是正確性了,因此在適配層為了滿足大數(shù)據(jù)計算的需求,Hadoop社區(qū)在S3A適配上花了很大力氣處理應(yīng)對這種問題,AWS自己也類似提供了EMRFS,支持ConsistentView。阿里云OSS提供了強一致性,JindoFS基于這一特性大大簡化,用戶和計算框架使用起來也無須擔心類似的一致性和正確性問題。

第四,原子性。

對象存儲自身沒有目錄概念,目錄是通過適配層模擬出來的。對一個目錄的操作就轉(zhuǎn)化為對該目錄下所有子目錄和文件的客戶端多次調(diào)用操作,因此即使是每次對象調(diào)用操作是原子的,但對于用戶來說,對這個目錄的操作并不能真正做到原子性。舉個例子,刪除目錄,對其中任何一個子目錄或文件的刪除操作失?。ò卦嚕?,哪怕其他文件刪除都成功了,這個目錄刪除操作整體上還是失敗。這種情況下該怎么辦?通常只能留下一個處于中間失敗狀態(tài)的目錄。JindoFS在適配這些目錄操作(rename,copy,delete and etc)的時候,結(jié)合阿里云 OSS 的擴展和優(yōu)化支持,在客戶端盡可能重試或者回滾,能夠很好地銜接數(shù)據(jù)湖各種計算,在pipeline 上下游之間保證正確處理。

第五,突破限制。

對象存儲產(chǎn)品是獨立演化發(fā)展的,少不了會有自己的一些獨門秘籍,這種特性要充分利用起來可能就得突破HCFS抽象接口的限制。這里重點談下對象存儲的高級特性Concurrent MultiPartUpload (CMPU),該特性允許程序按照分片并發(fā)上傳part的方式高效寫入一個大對象,使用起來有兩個好處,一個是可以按照并發(fā)甚至是分布式的方式寫入一個大對象,實現(xiàn)高吞吐,充分發(fā)揮對象存儲的優(yōu)勢;另外一個是,所有parts都是先寫入到一個staging區(qū)域的,直到complete的時候整個對象才在目標位置出現(xiàn)。利用阿里云OSS這個高級特性,JindoFS開發(fā)了一個針對MapReduce模型的Job Committer,用于Hadoop,Spark 和類似框架,其實現(xiàn)機制是各個任務(wù)先將計算結(jié)果按照part寫入到臨時位置,然后作業(yè)commit的時候再complete這些結(jié)果對象到最終位置,實現(xiàn)無須rename的效果。我們在Flinkfile sink connector支持上也同樣往計算層透出這方面的額外接口,利用這個特性支持了Exactly-Once的語義。

標配版:緩存加速

數(shù)據(jù)湖架構(gòu)對大數(shù)據(jù)計算的另外一個影響是存/算分離。存儲和計算分離,使得存儲和計算在架構(gòu)上解耦,存儲朝著大容量低成本規(guī)?;?yīng),計算則向著彈性伸縮,豐富性和多樣化向前發(fā)展,在整體上有利于專業(yè)化分工和大家把技術(shù)做深,客戶價值也可以實現(xiàn)最大化。但是這種分離架構(gòu)帶來一個重要問題就是,存儲帶寬的供應(yīng)在一些情況下可能會跟計算對存儲帶寬的需求不相適應(yīng)。計算要跨網(wǎng)絡(luò)訪問存儲,數(shù)據(jù)本地性消失,訪問帶寬整體上會受限于這個網(wǎng)絡(luò);更重要的是,在數(shù)據(jù)湖理念下,多種計算,越來越多的計算要同時訪問數(shù)據(jù),會競爭這個帶寬,最終使得帶寬供需失衡。我們在大量的實踐中發(fā)現(xiàn),同一個OSS bucket,Hive/Spark數(shù)倉要進行ETL,Presto要交互式分析,機器學(xué)習(xí)也要抽取訓(xùn)練數(shù)據(jù),這個在數(shù)據(jù)湖時代之前不可想象,那個時候也許最多的就是MapReduce作業(yè)了。這些多樣化的計算,對數(shù)據(jù)訪問性能和吞吐的需求卻不遑多讓甚至是變本加厲。常駐的集群希望完成更多的計算;彈性伸縮的集群則希望盡快完成作業(yè),把大量節(jié)點給釋放掉節(jié)省成本;像Presto這種交互式分析業(yè)務(wù)方希望是越快越好,穩(wěn)定亞秒級返回不受任何其他計算影響;而GPU訓(xùn)練程序則是期望數(shù)據(jù)完全本地化一樣的極大吞吐。像這種局面該如何破呢?無限地增加存儲側(cè)的吞吐是不現(xiàn)實的,因為整體上受限于和計算集群之間的網(wǎng)絡(luò)。有效地保證豐富的計算對存儲帶寬的需求,業(yè)界早已給出的答案是計算側(cè)的緩存。Alluxio一直在做這方面的事情,JindoFS核心定位是數(shù)據(jù)湖加速層,其思路也同出一轍。下面是它在緩存場景上的架構(gòu)圖。

結(jié)合阿里云上的EMR JindoFS優(yōu)化和實踐,數(shù)據(jù)湖怎么玩“加速”?

JindoFS在對阿里云OSS適配優(yōu)化的同時,提供分布式緩存和計算加速,剛剛寫出去的和重復(fù)訪問的數(shù)據(jù)可以緩存在本地設(shè)備上,包括HDD,SSD和內(nèi)存,我們都分別專門優(yōu)化過。這種緩存加速是對用戶透明的,本身并不需要計算額外的感知和作業(yè)修改,在使用上只需要在OSS適配的基礎(chǔ)上打開一個配置開關(guān),開啟數(shù)據(jù)緩存。疊加我們在適配上的優(yōu)化,跟業(yè)界某開源緩存方案相比,我們在多個計算場景上都具有顯著的性能領(lǐng)先優(yōu)勢?;诖疟P緩存,受益于我們能夠更好地balance多塊磁盤負載和高效精細化的緩存塊管理,我們用TPC-DS 1TB進行對比測試,SparkSQL性能快27%;Presto大幅領(lǐng)先93%;在HiveETL場景上,性能領(lǐng)先42%。JindoFS 的 FUSE支持完全采用 native 代碼開發(fā)而沒有 JVM 的負擔,基于SSD緩存,我們用TensorFlow程序通過JindoFuse來讀取JindoFS上緩存的OSS數(shù)據(jù)來做訓(xùn)練,相較該開源方案性能快40%。

在數(shù)據(jù)湖架構(gòu)下在計算側(cè)部署緩存設(shè)備引入緩存,可以實現(xiàn)計算加速的好處,計算效率的提升則意味著更少的彈性計算資源使用和成本支出,但另一方面毋庸諱言也會給用戶帶來額外的緩存成本和負擔。如何衡量這個成本和收益,確定是否引入緩存,需要結(jié)合實際的計算場景進行測試評估,不能一概而論。

高配版:深度定制,自己管理文件元數(shù)據(jù)

我們在JindoFS上優(yōu)化好OSS適配,把Jindo分布式緩存性能做到效能最大化,能滿足絕大多數(shù)大規(guī)模分析和機器學(xué)習(xí)訓(xùn)練這些計算?,F(xiàn)有的JindoFS大量部署和使用表明,無論Hive/Spark/Impala這種數(shù)倉作業(yè),Presto交互式分析,還是TensorFlow訓(xùn)練,我們都可以在計算側(cè)通過使用阿里云緩存定制機型,來達到多種計算高效訪問OSS數(shù)據(jù)湖的吞吐要求。可是故事并沒有完,數(shù)據(jù)湖的架構(gòu)決定了計算上的開放性和更加多樣性,上面這些計算可能是最主要的,但并不是全部,JindoFS在設(shè)計之初就希望實現(xiàn)一套部署,即能覆蓋各種主要場景。一個典型情況是,有不少用戶希望JindoFS能夠完全替代HDFS,而不只是Hive/Spark夠用就可以了,用戶也不希望在數(shù)據(jù)湖架構(gòu)下還要混合使用其他存儲系統(tǒng)。整理一下大概有下面幾種情況需要我們進一步考慮。

第一、上面討論對象存儲適配的時候我們提到,一些文件/目錄操作的原子性需求在本質(zhì)上是解決不了的,比如文件的rename,目錄的copy,rename和delete。徹底解決這些問題,完全滿足文件系統(tǒng)語義,根本上需要自己實現(xiàn)文件元數(shù)據(jù)管理,像HDFS NameNode那樣。

第二、HDFS有不少比較高級的特性和接口,比如支持truncate,append,concat,hsync,snapshot和Xattributes。像HBase依賴hsync/snapshot,F(xiàn)link依賴truncate。數(shù)據(jù)湖架構(gòu)的開放性也決定了還會有更多的引擎要對接上來,對這些高級接口有更多需求。

第三、HDFS重度用戶希望能夠平遷上云,或者在存儲方案選擇上進行微調(diào),原有基于HDFS的應(yīng)用,運維和治理仍然能夠繼續(xù)使用。在功能上提供Xattributes支持,文件權(quán)限支持,Ranger集成支持,甚至是auditlog支持;在性能上希望不低于HDFS,最好比HDFS還好,還不需要對NameNode調(diào)優(yōu)。為了也能夠享受到數(shù)據(jù)湖架構(gòu)帶來的各種好處,該如何幫助這類用戶基于OSS進行架構(gòu)升級呢?

第四、為了突破S3這類對象存儲產(chǎn)品的局限,大數(shù)據(jù)業(yè)界也在針對數(shù)據(jù)湖深度定制新的數(shù)據(jù)存儲格式,比如Delta,Hudi,和Iceberg。如何兼容支持和有力優(yōu)化這類格式,也需要進一步考慮。

基于這些因素,我們進一步開發(fā)和推出JindoFS block模式,在OSS對象存儲的基礎(chǔ)上針對大數(shù)據(jù)計算進行深度定制,仍然提供標準的HCFS接口,因為我們堅信,即使同樣走深度定制路線,遵循現(xiàn)有標準與使用習(xí)慣對用戶和計算引擎來說更加容易推廣和使用,也更加符合湖加速的定位和使命。JindoFS block模式對標HDFS,不同的是采取云原生的架構(gòu),依托云平臺我們做了大量簡化,使得整個系統(tǒng)具有彈性,輕量和易于運維的特點和優(yōu)勢。

如上圖示,是JindoFS在block模式下的系統(tǒng)架構(gòu),整體上重用了JindoFS緩存系統(tǒng)。在這種模式下,文件數(shù)據(jù)是分塊存放在OSS上,保證可靠和可用;同時借助于本地集群上的緩存?zhèn)浞荩梢詫崿F(xiàn)緩存加速。文件元數(shù)據(jù)異步寫入到阿里云OTS數(shù)據(jù)庫防止本地誤操作,同時方便JindoFS集群重建恢復(fù);元數(shù)據(jù)在正常讀寫時走本地RocksDB,內(nèi)存做LRU緩存,因此支撐的文件數(shù)在億級;結(jié)合元數(shù)據(jù)服務(wù)的文件/目錄級別細粒度鎖實現(xiàn),JindoFS在大規(guī)模高并發(fā)作業(yè)高峰的時候表現(xiàn)比HDFS更穩(wěn)定,吞吐也更高。我們用HDFS NNBench做并發(fā)測試,對于最關(guān)鍵的open和create操作,JindoFS的IOPS比HDFS高60%。在千萬級超大目錄測試上,文件listing操作比HDFS快130%;文件統(tǒng)計du/count操作比HDFS快1X。借助于分布式Raft協(xié)議,JindoFS支持HA和多namespaces,整體上部署和維護比HDFS簡化太多。在IO吞吐上,因為除了本地磁盤,還可以同時使用OSS帶寬來讀,因此在同樣的集群配置下用DFSIO實測下來,讀吞吐JindoFS比HDFS快33%。

JindoFS在湖加速整體解決方案上進一步支持block模式,為我們拓寬數(shù)據(jù)湖使用場景和支持更多的引擎帶來更大的想象空間。目前我們已經(jīng)支持不少客戶使用HBase,為了受益于這種存/算分離的架構(gòu)同時借助于本地管理的存儲設(shè)備進行緩存加速,我們也在探索將更多的開源引擎對接上來。比如像Kafka,Kudu甚至OLAP新貴ClickHouse,能不能讓這些引擎專注在它們的場景上,將它們從壞盤處理和如何伸縮這類事情上徹底解放出來。原本一些堅持使用HDFS的客戶也被block模式這種輕運維,有彈性,低成本和高性能的優(yōu)勢吸引,通過這種方式也轉(zhuǎn)到數(shù)據(jù)湖架構(gòu)上來。如同對OSS的適配支持和緩存模式,JindoFS這種新模式仍然提供完全兼容的HCFS和FUSE支持,大量的數(shù)據(jù)湖引擎在使用上并不需要增加額外的負擔。

總結(jié)

行文至此,我們做個回顧和總結(jié)?;跀?shù)據(jù)湖對大數(shù)據(jù)平臺進行架構(gòu)升級是業(yè)界顯著趨勢,數(shù)據(jù)湖架構(gòu)包括湖存儲、湖加速和湖分析,在阿里云上我們通過 JindoFS 針對各種場景提供多種數(shù)據(jù)湖加速解決方案。阿里云推出的專門支持數(shù)據(jù)湖管理的Data Lake Formation,可全面支持數(shù)據(jù)湖。
責任編輯:pj

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    從本質(zhì)上說,數(shù)據(jù)就是一個信息資源庫。人們常常將數(shù)據(jù)數(shù)據(jù)倉庫混為一談,但兩者在架構(gòu)和滿足的業(yè)務(wù)需求
    的頭像 發(fā)表于 05-20 12:38 ?641次閱讀
    什么是<b class='flag-5'>數(shù)據(jù)</b><b class='flag-5'>湖</b>?<b class='flag-5'>數(shù)據(jù)</b><b class='flag-5'>湖</b>和<b class='flag-5'>數(shù)據(jù)</b>倉庫有什么區(qū)別?

    阿里多云成本優(yōu)化暫停新用戶購買與續(xù)訂

    阿里計劃在 2024 年將多云成本運營功能與阿里云云遷移中心(Cloud Migration Hub)、阿里智能顧問(Intellige
    的頭像 發(fā)表于 05-16 17:19 ?596次閱讀

    阿里全面降價,釋放了什么信號?

    元宵節(jié)剛過,阿里就放了一個大招——今天(2月29日)上午,阿里發(fā)布通告,宣布全線下調(diào)產(chǎn)品官網(wǎng)售價。這次降價涉及計算、存儲、
    的頭像 發(fā)表于 04-16 08:05 ?145次閱讀
    <b class='flag-5'>阿里</b><b class='flag-5'>云</b>全面降價,釋放了什么信號?

    阿里內(nèi)部全面推行AI寫代碼

    阿里正在內(nèi)部全面推行 AI 編程,使用通義靈碼輔助程序員寫代碼、讀代碼、查 BUG、優(yōu)化代碼等。
    的頭像 發(fā)表于 04-07 09:22 ?577次閱讀

    阿里為什么能降價?釋放了什么信號?

    今天(2月29日)上午,阿里發(fā)布通告,宣布全線下調(diào)產(chǎn)品官網(wǎng)售價。這次降價涉及計算、存儲、數(shù)據(jù)庫等在內(nèi)的100多款產(chǎn)品,平均降價幅度超過20%,最高降幅達55%,屬于
    的頭像 發(fā)表于 02-29 17:37 ?1135次閱讀