基于基因信息的肺癌預后預測模型助力風險評估

DNA甲基化是一種可遺傳、可逆轉的表觀遺傳學特征，不同基因的甲基化程度，對基因表達有不同的抑制作用。3月21日，記者從南京醫(yī)科大學獲悉，該校公共衛(wèi)生學院陳峰教授課題組采用數據挖掘的統(tǒng)計分析手段，構建了基于生物標記物的肺癌預后預測模型，對患者生存時間的預測精度高達89%。研究結果在獨立人群中得到驗證，為肺癌風險評估與精準治療提供了有力證據。該成果近日發(fā)表于國際著名期刊《胸科》。

不同預后評分人群的K-M生存曲線及預測模型的ROC曲線，課題組供圖

肺癌位居惡性腫瘤死因首位，根據患者的遺傳特征，利用有效的生物標記物進行個體化風險評估，可以為病情發(fā)展提供判斷依據。而DNA甲基化就可作為一種生物標記物。

自2015年起，南京醫(yī)科大學公共衛(wèi)生學院陳峰教授課題組，便聚焦早期非小細胞肺癌預后的表觀基因組學研究，并與美國哈佛大學、西班牙巴塞羅那大學、挪威奧斯陸大學、瑞典隆德大學開展國際合作研究。

論文的作者之一、南京醫(yī)科大學公共衛(wèi)生學院張汝陽副教授介紹，團隊利用合作者的現有實驗室數據和公共數據，從表觀基因組學、轉錄組學出發(fā)，對38萬個基因指標進行分析，篩選具有主效應、交互效應的生物標記物，結合人口學、臨床指標，最終構建基于生物標記物的肺癌預后預測模型。

“此前人們并不了解到底有哪些基因的甲基化水平會影響肺癌患者的生存時間，我們從38萬個基因指標中發(fā)現，50多個基因甲基化和基因表達的生物標記物，會影響肺癌患者的生存時間。針對肺癌患者3年、5年存活率的預測精度，可分別達到88%和89%。根據目前的研究發(fā)現，這個模型是早期非小細胞肺癌預后預測精度最高的模型，將為早期肺癌臨床決策與治療提供參考?！睆埲觋栒f。