基于遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡和前饋神經(jīng)網(wǎng)絡的深度學習預測算法
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蛋白質二級結構預測是結構生物學中的一個重要問題。針對八類蛋白質二級結構預測，提出了一種基于遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡和前饋神經(jīng)網(wǎng)絡的深度學習預測算法。該算法通過雙向遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡建模氨基酸間的局部和長程相互作用，遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡的隱層輸出進一步送入到三層的前饋神經(jīng)網(wǎng)絡以便進行八類蛋白質二級結構預測。實驗結果表明，提出的算法在CB513數(shù)據(jù)集上達到了67.9%的Q8預測精度，顯著地優(yōu)于SSpr08和SC-CSN。
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